Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc8Q8VD72 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttc8Q8VD72 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms