Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms