Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms