Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkl1Q8K4J6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkl1Q8K4J6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms