Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim68Q8K243 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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