Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms