Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms