Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Phc3Q8CHP6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms