Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab43Q8CG50 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab43Q8CG50 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab43Q8CG50 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab43Q8CG50 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab43Q8CG50 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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