Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx8Q8CFD4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx8Q8CFD4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx8Q8CFD4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx8Q8CFD4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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