Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lin52Q8CD94 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lin52Q8CD94 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lin52Q8CD94 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lin52Q8CD94 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lin52Q8CD94 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lin52Q8CD94 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lin52Q8CD94 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin52Q8CD94 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Lin52Q8CD94 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lin52Q8CD94 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lin52Q8CD94 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lin52Q8CD94 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lin52Q8CD94 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lin52Q8CD94 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lin52Q8CD94 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lin52Q8CD94 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin52Q8CD94 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lin52Q8CD94 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lin52Q8CD94 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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