Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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