Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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