Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l1Q8C0J2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l1Q8C0J2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms