Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx16Q8C080 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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