Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQZ8

Kcns3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns3Q8BQZ8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcns3Q8BQZ8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcns3Q8BQZ8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms