Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Efr3aQ8BG67 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Efr3aQ8BG67 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms