Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfascQ810U3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms