Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim19Q80ZU4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim19Q80ZU4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim19Q80ZU4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Smim19Q80ZU4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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