Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nrde2Q80XC6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms