Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Zbed4Q80WQ9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed4Q80WQ9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms