Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdp1Q7TSG2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdp1Q7TSG2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms