Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms