Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LnpkQ7TQ95 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LnpkQ7TQ95 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms