Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms