Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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