Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms