Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms