Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rhox8Q6VSS7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rhox8Q6VSS7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms