Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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