Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asic1Q6NXK8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms