Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NipblQ6KCD5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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