Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg9bQ6EBV9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms