Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nop58Q6DFW4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms