Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zcchc2Q69ZB8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms