Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3cQ62181 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema3cQ62181 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms