Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PtprrQ62132 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprrQ62132 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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