Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PtafrQ62035 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtafrQ62035 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtafrQ62035 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtafrQ62035 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtafrQ62035 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtafrQ62035 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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