Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrrn1Q61809 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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