Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EsrrbQ61539 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms