Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms