Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi1Q61474 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms