Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms