Protein–RNA interactions for Protein: Q61152

Ptpn18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn18Q61152 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ptpn18Q61152 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ptpn18Q61152 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ptpn18Q61152 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ptpn18Q61152 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ptpn18Q61152 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ptpn18Q61152 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ptpn18Q61152 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ptpn18Q61152 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptpn18Q61152 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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