Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nab1Q61122 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Nab1Q61122 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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