Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp4Q61107 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp4Q61107 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms