Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamb3Q61087 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms