Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms