Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brip1Q5SXJ3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brip1Q5SXJ3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms