Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Med13Q5SWW4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Med13Q5SWW4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Med13Q5SWW4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Med13Q5SWW4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Med13Q5SWW4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Med13Q5SWW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Med13Q5SWW4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Med13Q5SWW4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Med13Q5SWW4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Med13Q5SWW4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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